Gastroskopi de yemek borusu divertikülü, yemek borusu kanseri, mide fıtığı, midede polip, mide kanseri, gastrit vb. hastalıkların tanısı konulmaktadır.Gastroskopi yutma güçlüğü, ağızdan kan gelmesi, yutulan yabancı cisimlerin çıkartılması, karın üst bölümlerinde ağrı, karında şişkinlik, karında gaz, dirençli kansızlık, nedeni bilinmeyen kilo kaybı, darlıkların genişletilebilmesi, midede ekşime ve yanma, hazımsızlık, bulantı ve kusma gibi yakınmaları araştırmak amacı ile gerçekleştirilir. Şüpheli alanlardan biyopsi alınarak patolojiye gönderilebilir. Ayrıca Helikobacter pylori adlı bakterinin tanısının konulabilmesi amacı ile de biopsi alınabilir.